北京蛋白质组研究中心

北京蛋白质组研究中心功能蛋白质组研究技术平台是国际人类肝脏蛋白质组计划（HLPP）表达谱和修饰谱项目的实施平台之一。平台可承接单项的蛋白质组学技术服务, 同时平台也开展规模化、高通量的蛋白质组学委托科研服务。服务项目包括样本制备、双向电泳、图像分析、胶内酶切、蛋白质鉴定、数据库查询与结果分析、免疫印迹及磷酸化蛋白质检测。一、 样品制备技术 1．适于双向电泳的蛋白质提取及定量。 2．亚细胞器提取及纯度评价（质膜、线粒体、内质网、细胞核、胞浆）。 3．Beckman公司Optima™ L-80 XP超速离心机。 4．Beckman公司Avanti™ J-25高速离心机。 二、电泳及电转系统 1. BIO-RAD公司PROTEAN IEF Cell等电聚焦仪。 2. BIO-RAD公司PROTEAN II xi Cell电泳槽。 3．BIO-RAD公司Mini-PROTEAN 3 Electrophoresis Module/Mini Trans-Blot Module。 4．Amersham pharmcia Biotech公司IPGphor等电聚焦仪。 5．Amersham pharmcia Biotech公司Ettan DALT II System。 6．Amersham pharmcia Biotech公司Hoefet miniVE electrophoresis and electrotransfer Unit。 7.图像分析软件BIO-RAD公司PDQuest™ 2-D analysis software version:7.11。 8.图像分析软件Amersham pharmcia Biotech公司Image Master™ 2D version:5.0。 9．自动切胶酶解系统为BIO-RAD公司Spot Cutter；WATERS公司MassPrep。 10．Amersham pharmcia Biotech公司Spot Handling Workstation。三、蛋白质组学中的核心质谱技术 基质辅助激光解析电离飞行时间质谱MALDI-TOF-MS（WATERS公司）：可测定生物大分子的分子量高达600KDa。通过肽质量指纹谱（PMF）和肽序列标签（PST）技术可高灵敏度、高通量、快速鉴定蛋白质，是蛋白质组学研究必不可少的生物质谱，也是临床蛋白质组学首选的技术。 还可分析寡核苷酸序列、多糖结构、聚合物分子量分布、特殊合成化学品等。 MALDI-TOF/TOF质谱仪（ABI公司）： 能从一个样品的PMF图谱中直接选择肽段离子进行片断化和MS/MS分析，而且分析可在数秒或数十秒内完成。该仪器是目前进行高灵敏度、高通量的蛋白质组分析非常理想的仪器。 电喷雾四极杆飞行时间串联质谱仪ESI-Q-TOF-MS（WATERS公司）:自动化的LC-MS/MS肽段测序功能，是多肽组学研究的重要技术。样品用量少，仅fmol样品就可测序（如电泳胶）。 离子阱串联质谱仪ESI-Ion Trap-MS （Thermo公司）：中心具有两台离子肼串联质谱仪（LCQ； LTQ各一台），高通量LC-MS/MS肽段测序功能，为SHOTGUN技术首选串联质谱。 中心最新引进的Finnigan LTQ-FT线性离子阱回旋共振质谱仪，是目前国际上蛋白质鉴定准确性最高的仪器之一，主要特点1.超高分辨率；2.精确质量数和多级串连质谱分析数据，现已投入使用。 四、培训及送样须知 平台可承接课题的技术服务。来人在本平台进修，学习。 送样品可为冻干粉、溶液或胶内蛋白质（必须为考染），冻干粉、溶液应无盐。样品如有毒性或腐蚀性或需特殊保存的样品，请事先说明。