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磷酸化是生物体内重要的蛋白质修饰种类,与酶活性,信号传导等多种极为重要的生物过程相关。因为含量很低,磷酸化信号大规模分析前一般需要先将其富集出来
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体外检测肿瘤细胞转移能力最常用的两种方法是细胞转移(transwell)、细胞侵袭(transwell ECM)实验。
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过表达(Over-Expression,OE)是上调基因表达最常用的方法,其基本原理是将目的基因的编码区(coding sequence,CDS)构建到质粒或病毒载体中,导入细胞内使基因的表达量增加。
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circRNA 是一类区别于传统线性RNA的非编码RNA分子,呈闭合环状结构,对RNase R不敏感,比线性RNA更加稳定。使用二代测序技术对其进行测序。
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Small RNA 是一类长度18-30nt的非编码RNA,主要包括miRNA、siRNA、piRNA三大类。使用二代测序平台对其进行测序及分析。
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RRBS(Reduced representation bisulfite sequencing) ,即简并代表性亚硫酸氢盐测序技术,仅对高CpG区域进行测序。
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从特定癌基因出发,利用RNAi技术沉默目标基因,并在细胞水平验证其功能表型(细胞增殖、凋亡、侵袭转移和血管新生等),在明确其功能基础上,进一步探讨其发挥作用的分子机制。
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Affymetrix基因芯片堪称经典,是基因功能研究领域目前应用广泛的一种基因芯片,大量科学工作者采用Affymetrix基因芯片进行科学研究并且发表的高质量SCI论文已有25000多篇。
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